sp|Q9SAG8|DNAJ8_ARATH ----> Chaperone protein dnaJ 8, chloroplastic


Intron 1 GTATATTGAA ... CTGGTTACAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A131.58182184
A236.2321310121
A332.442771133
A426.79194071
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A733.874512231
A834.795665302
A932.558854427
A1034.194872253



>TRINITY_DN45178_c0_g3_i4 from sample A6 / Example spliced isoform
CCTGGGGCTACTGAGAAAGATGTTAAAACTGCCTTCAGACGCCTTGCGTTGCAGCATCATCCTGATGTTTGCAAAGGAGATAACTGTGGAATTCAATTTCACAAGATCAATCAGGCTTATCAGTCTGTAATGTCCAGTTTGACACAAGCAAAGCAGCAAAATGTTTCCAACGATTACTATATGGATGGCCTTAACGATTA
TTGCGACGAGTGGGAAGAATGGATGGGATGGGAAGGAGCTGGAACCCTTGATTATTCCTCCCATATCAACATGTATTATGCCTGATTAAATCTTTATCCATGTCTGCTGGCCTTGTAAATAGTTAGGCCTTTTCAAGACCATCCCCATTTCATGGCCTACCGCTGAAATTCTTGTGAATACAACATAATCTTTTACTTGG
ACAGCTAATTTTATTTCTATTGCATCGGCTTCTGCTTCAGAAAGGGCTTCTTGATTCAGATGAGCAACAATGTTAACCAGTTATGGCCTACCGCTGCTATTGCATCGGCTTCTGCTTCAGAAAGGGCTTCTTGATTCAAATGAGCAACAGCTTTTTTTTTTGAGATCTATCTATCGTAAGACTCATTTGCTTCGCTCATG
GATTCTGATTTTAAGACTCCTTGTATATACGCTCTGTTTATTTTAATCTCTTAACTTGTACAGACCTTTGGATCTCTCTTTTAAGACTCATTTGCTTTGCTCATGGGTTCTGATTTTAGGGATCATGCCGATGCTACGAGGATCTGCTCTTAAATGAAGAGCTAAATATTCTTGTTGTATTGCAATGTTATTCGATGAAT
AGAAATTGGAAACCATTATTCTGACCAGATAGATCTGTGTGTCATTTATCTATGAATGCTGTAGTTTCATTCTAGTGTGCTTTTCTAGTAGTTGCATTCGTGTACTTTTCTACAGGTATATCATACTTTAAATTTTTGAAACAAAGGATGATAAGTATGGGCAAATCTGGTTTTATTCACAATTTTTGAAACAAAGGATG
ATAAGTATGGGCAAATCTGGTTTTATTCACAATTTTTGAAACAAAGGATGATA


>TRINITY_DN45178_c0_g3_i2 from sample A6 / Example unspliced isoform:
CCTTCAGACGCCTTGCGTTGCAGgtatattgaaatgcccatttgaaacaagagaacctcttcttttaaataataattttccatgtttgaagctaaagagtaaaatagaaattagatattgtgaggctgtagaaattggaatgcttgaaagcagctatctcacacattcttgaaaatttcaagaaacggtgtgttcttgaa
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GCTTATCAGTCTGTAATGTCCAGTTTGACACAAGCAAAGCAGCAAAATGTTTTCAACGATTACTATATGGATGGCCTTAACGATTATTGCGACGAGTGGGAAGAATGGATGGGATGGGAAGGAGCTGGAACCCTTGATTATTCCTCCCATATCAACATGTATTATGCCTGATTAAATCTTTATCCATGTCTGCTGGCCTT
GTAAATAGTTAGGCCTTTTCAAGACCATCCCCATTTCATGGCCTACCGCTGAAATTCTTGTGAATACAACATAATCTTTTACTTGGACAGCTAATTTTATTTCTATTGCATCGGCTTCTGCTTCAGAAAGGGCTTCTTGATTCAGATGAGCAACAATGTTAACCAGTTATGGCCTACCGCTGCTATTGCATCGGCTTCTG
CTTCAGAAAGGGCTTCTTGATTCAAATGAGCAACAGCTTTTTTTTTTGAGATCTATCTATCGTAAGACTCATTTGCTTCGCTCATGGATTCTGATTTTAAGACTCCTTGTATATACGCTCTGTTTATTTTAATCTCTTAACTTGTACAGACCTTTGGATCTCTCTTTTAAGACTCATTTGCTTTGCTCATGGGTTCTGAT
TTTAGGGATCATGCCGATGCTACGAGGATCTGCTCTTAAATGAAGAGCTAAATATTCTTGTTGTATTGCAATGTTATTCGATGAATAGAAATTGGAAACCATTATTCTGACCAGATAGATCTGTGTGTCATTTATCTATGAATGCTGTAGTTTCATTCTAGTGTGCTTTTCTAGTAGTTGCATTCGTGTACTTTTCTACA
GGTATATCATACTTTAAATTTTTGAAACAAAGGATGATAAGTATGGGCAAATCTGGTTTTATTCACAATTTTTGAAACAAAGGATGATAAGTATGGGCAAATCTGGTTTTATTCACAATTTTTGAAACAAAGGATGATA