sp|P0C2F6|RNHX1_ARATH ----> Putative ribonuclease H protein At1g65750
Intron 1 GTAAAATTAT ... GTGAACGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 33.33 | 34 | 26 | 8 |
| A2 | 34.69 | 16 | 8 | 9 |
| A3 | 36.17 | 15 | 9 | 8 |
| A4 | 50 | 7 | 8 | 6 |
| A5 | 40 | 6 | 5 | 3 |
| A6 | 16.88 | 32 | 9 | 4 |
| A7 | 20.63 | 25 | 10 | 3 |
| A8 | 35.71 | 18 | 11 | 9 |
| A9 | 31.71 | 14 | 7 | 6 |
| A10 | 27.27 | 12 | 4 | 5 |
>TRINITY_DN114238_c0_g1_i1 from sample A1 / Example spliced isoformTCTGGAACAACGATTGAATGAGTGGCCCTATCCCACTACCCGCATACCTCAATACCCAAACGGAGGCTGAAAACATCGACATCGAAGATAGTCAATTTTTTTGGCTAGGGTTTAGGGTTTCAGGACGTCATCCTCAGCCTTAGTCATTTTCCATTTTCCCTGTCATTTTTTTTGTTGCCATGGTTTAAGGACGTTATCCT
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TGGGTAGATGCGGATTACTTTTCAGGGGAAATAAGAGACCTTATCACTCTGTTGGAGGGGAAAAAGAAGAAAATATTGAGTCATATTGAAGAATCATGGAGGCTAAAAAGTCGAGCTGTCTGGATTCAGTTAGAAGATAATAATACTAAGTTTTTTCATCGCTTTGCCAACCAGCGACGTCTTTGCAATGCTATTTGGGA
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TAAAATTCCTTAAAAAGAAATCCAAAGACAAAAGTCCAGGCCCTGATGGCTGAACGATGGAATTTTTCATCCACTTTTTTGATATCTTCAGAAGTGACATTACTGATGCTGTTAACAAAACCAGATGTAGGGGCCAGATACCGAGTGATTTAAATTCTACTTTTATTACTCTAGTACCCAAGAAAGATAGGCCTTGTGAT
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TTTCATTCTTAATATGGACCTTACAAAATCTTACAATAGGGTTGACTGGGCCTATATTCGTTTTATCCTGATCCAAATTGGCCTGGAAGTGGAGACTGTTAATTGGATTATGGTTTGTATATGCTCCACGAGATATGTAGTTTTACTAAATGGCTCGCCGACCCCTTACTTTACTGGTGATACGGGACTTAGACAGGGAT
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GAGAATTCAGAGAAGAAACGGTTCATGGGAATATAAGGCTCTTTCTCTAGGGGGCACCTTATTCTTGTTTGTTCTGTGTTACAAAGTGTCATGTTCTATTGGTTCTCCCTCTTCTTGGTTCCTGCTTCGGTGATTTCGGCTGTGCGCAGACTCATATTCCAGTTTCTTTGGGGGAGTAATTCGGGTGTTACAAATTTCCA
TTTTTCCTCTTGGGAGAAACGTTCTCATCCCAAAATTTTAGGAGGTTGGGTTATAAAGGATCTCAAATTTTTTAACATGTCATTATGTGCTAGGAGTCTTTGGCGTTGTCTATTTGACTCGGGACTATGGGGTAAAGTGGTTAGAGAAAAATATCTATATCGTTTACCTCCTGTTTATTGGCTCCATTATGGTAAAAAGC
TTCCCTCGGGATCGATTATGTGGAGGATTTTAGTAAAATCTTGGTCGATTATCAATTATGCTATCAGTTGGGTCGTTGGTCGGGGGACCCATATTTTTGTATGGATCGATCCTCTCCTGGGTCTTGGTCAAGGCTATAAGCTTTCTTGGGGGATTATTGAGGCCTTACATGCTAAAGGTTTTTATGTTTTGAACTAGGTA
TGGATCCCCGGTGATGGTGTCAACTGGTTATCAGTGTTGGATTTGGAATTAGATCCTGTTGTAGCGCCGGAATGGGATTGTTATGTTGACAACCTTCAGCAGGCTGGCATTTTTCTTTCAGAATATTAAGAAAATATGGTCTATCAAATCCACTGAAGATTCGGTGCTTTATGTGGCTCGTTATGCAAAACAATATTCTT
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CTCTATTTTCTCCTCTTAAGATATGCTTTTGTTTCTTAATTTGAATCCCTGT
>TRINITY_DN114238_c0_g1_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:TCTGGAACAACGATTGAATGAGTGGCCCTATCCCACTACCCGCATACCTCAATACCCAAACGGAGGCTGAAAACATCGACATCGAAGATAGTCAATTTTTTTGGCTAGGGTTTAGGGTTTCAGGACGTCATCCTCAGCCTTAGTCATTTTCCATTTTCCCTGTCATTTTTTTTGTTGCCATGGTTTAAGGACGTTATCCT
CAGCCTCAATAATTTTCCATTTTTATAGTTTACTGCAATTTTGATTCGCTCTACATCGAGTTATGTTAGAAAACCCACAGCAAAAGTTCTATCGTTGAGAGAATAGCGAATCTTTATTTTCTTTTTCCTGCACTTATGTAAAGATTTCTTCTATTTAATTTTCATTATCGATGGATGTACATGAATAACAGAAGAAACCC
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CATTTTCCTTGATGGGGTTTCGTGGACTGGGGGAGTATGTTACTATTCCGTTTATGACATGGAGTCACCAGTCGGTTTTGACCCTCTGCCTTTGTTTCCTCTACCTTGTGGAGGTGGTGCAGGTTTTTCGTAGTTTTCCCCTTCAAGTGTTGGTTATTTTCAGAGGTCTGTTAAAACAAATCCTTTGTCCTCTATGATAT
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TTCAATGACTACATACCAATTTCTCTTTGTAACCTCTTGGATAAGATCATTACAAAAATCATTTATGAAAAACTTAAACCTTTTCTTGGAAGGTTTGTGTCGGTTGAACAGTTCGGATTCCTTCCTAATCATCAGATTCTTGATGCAATGGGGGTTGCCCAGGAGGGTTACCACTCGGTTAAGGCGGAGAAACATGATGC
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TTCCCTCGGGATCGATTATGTGGAGGATTTTAGTAAAATCTTGGTCGATTATCAATTATGCTATCAGTTGGGTCGTTGGTCGGGGGACCCATATTTTTGTATGGATCGATCCTCTCCTGGGTCTTGGTCAAGGCTATAAGCTTTCTTGGGGGATTATTGAGGCCTTACATGCTAAAGGTTTTTATGTTTTGAACTAGGTA
TGGATCCCCGGTGATGGTGTCAACTGGTTATCAGTGTTGGATTTGGAATTAGATCCTGTTGTAGCGCCGGAATGGGATTGTTATGTTGACAACCTTCAGCAGGCTGGCATTTTTCTTTCAGAATATTAAGgtaaaattatatgggcatataatttttctgatggttcagtgattgctaaattagcgtattcatgcttgat
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GGATCCTGTGGTTTCTTCCAATCTCTTTTGAGAGTCCTGGACATTCATTTTCCTTCTTGGATTTCCTACGATCGTGCTACTATTATAGAGAATCTGCAACTTTGGTTTGCTCGACATTGTGGGTCTCGGCCTCTTATCTTCTTTATTTGTTGGGAGGTTTGGAAATCCCGTAACAGGCTTATCTTTTAGAATGTTAAGAC
TCTGGTATGTTTGGTTTCTTCGAAGGTTCTAGTGATTTTTTGGGAATGCAGAGATTATTGGTCTAGTAAATTAACAAAGTATCGCCTTTGCTCTAAATCGGATTACACTTTTCCGCTTGGATATTTTCACGGTACAACGAATCCTGGGTTGTGCGGTGCAAGGATGATACTGAATATGGATCATGGTCATGTTTTCCGGT
TCACTTTTGAAGGCAGGTATGGGTACCAACACTTGGGAGGAGCTCATAGCATTGCGGGGTCTTCTTTGGTGTGCTAGAAAAAAAGGTATACATACTTTTCAGGGTTTTGGAGACTCCCTTTGTGTTGTTCAATGGGCAAGTGGAAAATCTTGTTTGCGCTCAATTATGTTAGAAGGGTGGAAGAAGAGGATTTCCATTTT
GATAGTTGCTTTCTCTCATATTTCTGTCTGTCTTCCACATCCTTAGACACTACAATGGAGAAGCTGAATTTTTATCAAAAGGAGCTCTGGGTCCTATGGATGGAAATATGTTATCGAAGGAGTACAGGGTTGGGGTATTGATTAAATAAGAAACTCTATATTTCTGATAAGCTGGAATGTTTTTTAGTTTTTGGATCAAG
CATGTGTCTCTTTGTCAGATGTAATATGTTTACAACTTAGGGGTCCTATCTTGCCTTTATTATTAATATCGGACCTCCGTTGAACATTTGTTTTTGAATACATTGGAAAAAGTAAACTGTGACTAACTGTCTTTCGAAGATCGACTGGAGTTAGCATCTCGCTTCGCCAGGATGGTTGTATTTTGTTGATGCAACTTTTT
ACTTAATAAAGAAGTTGCTTTTTTTCTCTCTGAAAAAAAAATATTCTAGTGTGTGACTGTAAGTGATTTTATCTGTCTAATATTTGGGAATACTTTCGCTATCATTACATATTACATTTATTTTCTTTTATGAGTGGCTTGGGAATTGGTACTGTAACTGTAATTGATTTTATCTTTGTCATATTTGGTAATGCTTTCGC
TACCATTGCATTTATGCGTAGAATGGATGGACATATGCGTAATTGTCATGGAGCATATCAGATTTGCCTTAGATGAAGCCACATGATCTCTAACTTCTATGCAGCACAGTCTCTATTTTCTCCTCTTAAGATATGCTTTTGTTTCTTAATTTGAATCCCTGT