NA ----> NA


Intron 1 GCTAGTTTCC ... TACTGTGGAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A17661622
A271.05112727
A373.0872018
A466.15111825
A51000109
A680.65124753
A779.27205499
A871.21194153
A981.08143783
A1075.94164160



>TRINITY_DN107939_c0_g1_i2 from sample A3 / Example spliced isoform
AATTTGCAAAGGGTAAGGCTGATAGCAGAGATTGCAGAGAGTAAGTTAGCATTTAGCGGACATTCCAAGCTAGTTAAGAATTTAACCCGGATAGCCGAGGCCCTAAGGAGCCATAGGTATGAGCCTTTAGCTTTGCGGACACTCGTTAGAACCTACATGTAACTAATTGACAGGACCAACTTTGCCTTATGGCTATCAGA
TTGGACCAGTGCTCCGTGAAATTTGATACACCAATCCCAATGTGATGGGCTTTGTGGATGAGGCTGAATCCTTCCTGGAGCACTCCGCATTGTTTATTAGATGAAGGGGAGCATTACTCGGGATGACTTTAAAGAAGTTATGAACATTGGGCCTTCAAGATTTGCTGAAGAAGGAAAGGGGGAAACAGTCATTGATCTAC
AGGTGATGCTAAATGAATTAAAAAATGACAACTTTGCATTTGACAATCCCGAGGATGTGTTTATCTAAGTGACAACTACAGTAAGGGGAAGTGAGTTCATTGAGATCACTACAAGAGATTGTCCAATCCATACGTGTAAAAGATTTGATTTTGCGAGGTTGCAGTCTTCTCCCTCTATTAAGTAGCTTCTCAACTCAATA
TGAAGATAAGTAGTTCTGGTAGCTTAAGTCTCTGATCTTGAGACCTTTCAAAAGTTGAAATCTATTTATTCTTCCTTTGGTTTTGGACCTTGGTAGTTATTGCTATGTTGTCATGATGTCAATGAATAGGGGAGGAATTTCAAGCATGCAATTCACTCAAATTCTTGTTCCTCCATGCCTTATGAAGTTATGAACATGAT
TCAGCTATCCGGATACGATATATATGAAAGTATTTCAGAGCATTTGTAGAAGGAAGCCTACTTTTGTTTCTTCTTCGAGGGGATATGGATATTGATAATCTATGATTATTTTCCGATCCAAGGGAGAAATGACATACCGCAACAGTGGAATACATAAACCTAAACAGAATTACTTAGTTAATTTTATTTTCTTCTTGCCT
TTGATAGTGCATATAGTCACTAAGGATATTATCCTGCATATGGGTGATGTTGGTTAAGTATCTTTACTCAAAGCCAATGAATGTGTGGTCTAGTGGCAAGTTGTGAGGTGATCAAGCTTGTATTGATGATGGAACTTGTGGTCAAAATCTCCGAGTAGGTGCAAATGAGGCAAGATGCAAACTAGTTGATAAACTACTTT
GGCCCAAATTATCATTACTTAGTTGATTCTTGTTAAATTTGAGGACTTGGGTGGATTCCACCACTCTGGTAGTCCCTAACTCATTCTTTTTGCTGTACCTTATAGTAGGTGTAGCTACATTTGACAATTAGGCCTCTTCTTTTCTAGTTTCTTCC


>TRINITY_DN107939_c0_g1_i1 from sample A3 / Example unspliced isoform:
AATTTGCAAAGGGTAAGGCTGATAGCAGAGATTGCAGAGAGTAAGTTAGCATTTAGCGGACATTCCAAGCTAGTTAAGAATTTAACCCGGATAGCCGAGGCCCTAAGGAGCCATAGGTATGAGCCTTTAGCTTTGCGGACACTCGTTAGAACCTACATGTAACTAATTGACAGGACCAACTTTGCCTTATGGCTATCAGA
TTGGACCAGTGCTCCGTGAAATTTGATACACCAATCCCAATGTGATGGGCTTTGTGGATGAGGCTGAAGCCTTCCTGGGGCACTCCGCATTGTTTATTAGgctagtttcccaactcgttgaacactgtttgttccatatattttgcgcagtgtaagaatggtcatggcttctgttttcactcttccaattgcaattccat
catccaacacgagtaaagggccacattcatggctaccccactgcacgaactttacaaagggaagaagatcggagaggcaacagggcttgaaaatggtggtccttgcagcgagcagtggaggtggctgctgtgggggcagcagtagcagcagcagcagtggaggtggctgctgtgggggcagcagtagcagcagcagcagt
ggaggaagctgcagcagccacgggaaatcttcaggtcctgatctttccaaaattggaaaagagtttgaaaccatggttgccagagccacgttgagtgaacgtgagaaggaatacaatactgtggagATGAAGGGGAGCATTACTCGGGATGACTTTAAAGAAGTTATGAACATTGGGCCTTCAAGATTTGCTGAAGAAGG
AAAGGGGGAAACAGTCATTGATCTACAGGTGATGCTAAATGAATTAAAAAATGACAACTTTGCATTTGACAATCCCGAGGATGTGTTTATCTAAGTGACAACTACAGTAAGGGGAAGTGAGTTCATTGAGATCACTACAAGAGATTGTCCAATCCATACGTGTAAAAGATTTGATTTTGCGAGGTTGCAGTCTTCTCCCT
CTATTAAGTAGCTTCTCAACTCAATATGAAGATAAGTAGTTCTGGTAGCTTAAGTCTCTGATCTTGAGACCTTTCAAAAGTTGAAATCTATTTATTCTTCCTTTGGTTTTGGACCTTGGTAGTTATTGCTATGTTGTCATGATGTCAATGAATAGGGGAGGAATTTCAAGCATGCAATTCACTCAAATTCTTGTTCCTCC
ATGCCTTATGAAGTTATGAACATGATTCAGCTATCCGGATACGATATATATGAAAGTATTTCAGAGCATTTGTAGAAGGAAGCCTACTTTTGTTTCTTCTTCGAGGGGATATGGATATTGATAATCTATGATTATTTTCCGATCCAAGGGAGAAATGACATACCGCAACAGTGGAATACATAAACCTAAACAGAATTACT
TAGTTAATTTTATTTTCTTCTTGCCTTTGATAGTGCATATAGTCACTAAGGATATTATCCTGCATATGGGTGATGTTGGTTAAGTATCTTTACTCAAAGCCAATGAATGTGTGGTCTAGTGGCAAGTTGTGAGGTGATCAAGCTTGTATTGATGATGGAACTTGTGGTCAAAATCTCCGAGTAGGTGCAAATGAGGCAAG
ATGCAAACTAGTTGATAAACTACTTTGGCCCAAATTATCATTACTTAGTTGATTCTTGTTAAATTTGAGGACTTGGGTGGATTCCACCACTCTGGTAGTCCCTAACTCATTCTTTTTGCTGTACCTTATAGTAGGTGTAGCTACATTTGACAATTAGGCCTCTTCTTTTCTAGTTTCTTCC



Intron 2 GTTGCAGTCT ... CAATGAATAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A160.53152323
A262.167194
A366.0491421
A451.11111013
A557.587514
A663.92355569
A767.8337366
A868.42367779
A960.17475785
A1064.5305059



>TRINITY_DN100400_c0_g1_i4 from sample A4 / Example spliced isoform
GGCTGATAGCAGAGATTGCAGAGAGTAAGTTAGCATTTAGCGGACATTCCAAGCTAGTTAAGAATTTAACCCGGATAGCCGAGGCCCTAAGGAGCCATAGGTATGAGCCTTTAGCTTTGCGGACACTCGTTAGAACCTACATGTAACTAATTGACAGGACCAACTTTGCCTTATGGCCATCAGATTGGACCAGTGCTCCG
TGAAATTTGATACACCAATCCCAATGTGATGGGCTTTGTGGATGAGGCTGAATCCTTCCTGGAGCACTCCGCATTGTTTATTAGGCTAGTTTCCCAACTCGTTGAATACTGTTTGTTCCATATATTTTGCGCAGTGTAAATGGTCATGGCTTCTGTTTGCACTCCTCCAATTGCAATTCCATCATCCAACACGAGTAAAG
GGCCACATTCATGGCTACCCCACTGCACGAACTTTACAAAGGGAAGAAGATCGGAGAGGCAACAGGGCTTGAAAATGGTGGTCCTTGCAGCGAGCAGTGGAGGTGGCTGCTGTGGGGGCAGCAGTAGCAGCAGCAGCAGTGGGGGCAGCAGCAGTGGAGGAAGCTGCAGCAGCCACGGGAAATCTTCAGGTCCTGATCTT
TCCAAAATTGGAAAAGAGTTTGAAACCATGGTTGCCAGAGCCACGTTGAGTGAACGTGAGAAGGAATACAATACTGTGGAGATGAAGGGGAGCATTACTCGGGATGACTTTAAAGAAGTTATGAACATTGGGCCTTCAAGATTTGCTGAAGAAGGAAAGGGGGAAACAGTCATTGATCTACAGGTGATGCTAAATGAATT
AAAAAATGATAACTTTGCATTTGACAATCCCGAGGATGTGTTTATCTAAGTGACAACTACAGTAAGGGGAAGTGAGTTCATTGAGATCACTACAAGAGATTGTCCAATCCATACGTGTAAAAGATTTGATTTTGCGAGGGGAGGAATTTCAAGCATGCAATTCACTCAAATTCTTGTTCCTCCATGCCTTATGAAGTTAT
GAACATGATTCAGCTATCCGGATACGATATATATGAAAGTATTTCAGAGCATTTGTAGAAGGAAGCCTACTTTTGTTTCTTCTTCGAGGGGATATGGATATTGATAATCTATGATTATTTTCCGATCCAAGGGAGAAATGACATACCGCAACAGTGGAATACATAAACCTAAACAGAATTACTTAGTTAATTTTATTTTC
TTCTTGCCTTTGATAGTGCATATAGTCACTAAGGATATTATCCTGCATATGGGTGATGTTGGTTAAGTATCTTTACTCAAAGCCAATGAATGTGTGGTCTAGTGGCAAGTTGTGAGGTGATCAAGCTTGTATTGATGATGGAACTTGTGGTCAAAACCTCCGAGTAGGTGCAAATGAGGCAAGATGCAAACTAGTTGATA
AACTACTTTGGCCCAAATTATCATTACTTAGTTGATTCTTGTTAAATTTGAGGACTTGGGTGGATTCCACCACTCTGGTAGTCCCTAACTCATTCTTTTTGCTGTACCTTATAGTAGGTGTAGCTACATTTGACAATTA


>TRINITY_DN100400_c0_g1_i3 from sample A4 / Example unspliced isoform:
CGAGCAGTGGAGGTGGCTACTGTGGGGGCAGCAGTAATAGAGGCAGCAACAGTGGAGGAAGCTGTAGCAGCCACGTGAAATCTTCAGGTCCTGATCTTTCCAAAATTGGAAAAGAGTTTGAAACCATGGTTGCCAGAGCCACGTTGAGTGAACGTGAGAAGGAATACAATACTGTGGAGATGAAGGGGAGCATTACTCGG
GATGACTTTAAAGAAGTTATGAACATTGGGCCTTCAAGATTTGCTGAAGAAGGAAAGGGGGAAACAGTCATTGATCTACAGGTGATGCTAAATGAATTAAAAAATGATAACTTTGCATTTGACAATCCCGAGGATGTGTTTATCTAAGTGACAACTACAGTAAGGGGAAGTGAGTTCATTGAGATCACTACAAGAGATTG
TCCAATCCATACGTGTAAAAGATTTGATTTTGCGAGgttgcagtcttctccctctattaagtagcttctcaactcaatatgaagataagtagttctggtagcttaagtctctgatcttgagacctttcaaaagttgaaatctatttattcttcctttggttttggaccttggtagttattgctatgttgtcatgatgtca
atgaatagGGGAGGAATTTCAAGCATGCAATTCACTCAAATTCTTGTTCCTCCATGCCTTATGAAGTTATGAACATGATTCAGCTATCCGGATACGATATATATGAAAGTATTTCAGAGCATTTGTAGAAGGAAGCCTACTTTTGTTTCTTCTTCGAGGGGATATGGATATTGATAATCTATGATTATTTTCCGATCCAA
GGGAGAAATGACATACCGCAACAGTGGAATACATAAACCTAAACAGAATTACTTAGTTAATTTTATTTTCTTCTTGCCTTTGATAGTGCATATAGTCACTAAGGATATTATCCTGCATATGGGTGATGTTGGTTAAGTATCTTTACTCAAAGCCAATGAATGTGTGGTCTAGTGGCAAGTTGTGAGGTGATCAAGCTTGT
ATTGATGATGGAACTTGTGGTCAAAACCTCCGAGTAGGTGCAAATGAGGCAAGATGCAAACTAGTTGATAAACTACTTTGGCCCAAATTATCATTACTTAGTTGATTCTTGTTAAATTTGAGGACTTGGGTGGATTCCACCACTCTGGTAGTCCCTAACTCATTCTTTTTGCTGTACCTTATAGTAGGTGTAGCTACATT
TGACAATTA