NA ----> NA
Intron 1 GTCTGTGATG ... ATTCCCGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 100 | 0 | 1 | 11 |
| A2 | 57.89 | 8 | 6 | 16 |
| A3 | 66.67 | 2 | 3 | 5 |
| A4 | 77.78 | 2 | 3 | 11 |
| A5 | 71.43 | 2 | 2 | 8 |
| A6 | 70.73 | 6 | 11 | 18 |
| A7 | 70.37 | 4 | 5 | 14 |
| A8 | 100 | 0 | 2 | 5 |
| A9 | 61.11 | 7 | 8 | 14 |
| A10 | 100 | 0 | 4 | 10 |
>TRINITY_DN33890_c0_g1_i3 from sample A6 / Example spliced isoformTATTAATGGATAAAATGCTTCCTTAAAATGATCTCAGTAATGATCTAAACGAACATGTAAATATGAAACAATCATTTATTCAAATCTATATGAATGATGATCACCATGTGATGTTGGATACAAATTTCAAGAAAGTCAAAATTTGAAGCTTTCCCCTACGATTGTGGGTTTATCTCGGTTTTTCCTCTATAGAATTCAAA
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>TRINITY_DN33890_c0_g1_i2 from sample A6 / Example unspliced isoform:TATTAATGGATAAAATGCTTCCTTAAAATGATCTCAGTAATGATCTAAACGAACATGTAAATATGAAACAATCATTTATTCAAATCTATATGAATGATGATCACCATGTGATGTTGGATACAAATTTCAAGAAAGTCAAAATTTGAAGCTTTCCCCTACGATTGTGGGTTTATCTCGGTTTTTCCTCTATAGAATTCAAA
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GAAACATGGTTGTTTATTGCCTGTCATTGTTGACAAAAGTTTGTTGTAGATATTCTGCATATATTTGCATATAGTCTATTCACTACCATAATTGAGACACCTAAAATGGAAACATGGAACCAGGTAAAATCTTCAGGATACCCTGCAATATATGTGAAGGTCCTTGTAAATAGTTTTTTTCTCTGCTGCAAAATTTTCAG
CAGTTATTGCCTAAAAGTTGTTTTGTAGGACCTGATTTCCAGTATACAATCAATTGTTTCTATCCAGCTTAAGTTATAGCACCACCCCATCTTTTAATTTAATATTTTTTGAGAATTTCTGAAAGCTCTTGGTGTGCTCTGGCAGGAATTGCCTCTGACTTTTAGGGACTATCTACTTAAATTTAAAGTTGAGTGATATT
TTGTATGCAATTTTGAGAATTATGATCCATTATTATCATGGTTCAGTGTGTGAAGTTCCAAACTTAAAATGATACTGCCGAGGCAGTGGTTCAACACTGCTGATGTTGAACAAGTTTAGTTTACTCTTCTTATTAAAATTTGAAGGATATGTCTGTCAAACTTATGGTAATTTCAACCCCACCTTTAACAATGGCAAAGA
TAGATCATTTTCGGTATTGTTGTTGCTTTGGGTCTAATTAATATATTTCTTCATCAAATACTCGTGATCTTTGTAAGAAGGTTGATTGTCCGTGATCAGGAAGTTTCTCAGGCATGTATATTGATACCAAGAAACCATAGAGCGTTTGCAGGAAAGATATGGTTACCTATGTCCATACAGGTCCACATCAATAACAATGT
CGAATTGAGCATTTTTTCCCATTTGTATAGAACATGTTCTTGTCTTGGATATGTGGCATGTAACTATTTGCTGAATGACCTGATTATTGTAGTTGAGGTTAAATCTTCATTCTGGCCTACATAGACTGTCATAGTTATGACAATTTGGATTCTCTTTAATGATACTTCTGGCTCGGCAAAAGTAAAAGTTAATTTGCAAG
AAACCTTAG