NA ----> NA
Intron 1 GTACGAACAC ... AATCAATCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 91.3 | 2 | 15 | 27 |
| A2 | 60.71 | 11 | 14 | 20 |
| A3 | 53.33 | 7 | 4 | 12 |
| A4 | 49.02 | 13 | 10 | 15 |
| A5 | 57.58 | 7 | 8 | 11 |
| A6 | 66.67 | 1 | 4 | 0 |
| A7 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A8 | 50 | 1 | 0 | 2 |
| A9 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A10 | -1 | 0 | 0 | 0 |
>TRINITY_DN106436_c3_g2_i12 from sample A4 / Example spliced isoformACATTTTGATGATATTCATTATATACCTCTTCTTGACAAGACATACGAACCCCTTTATGACGGCTCCAAGACAAATATTCTCTCTGCTATATTGTTGGTAATGAACTTGAAGGTTATGAATGGTCTTTCAAACATATCAGTCACACGGATGTTAAGGTATGTAATATATTCCATCACATATATATGATTGCGCTAAAGGT
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ATATTATTGTTACAGTATGTTCTACCT
>TRINITY_DN106436_c3_g2_i4 from sample A4 / Example unspliced isoform:ACATTTTGATGATATTCATTATATACCTCTTCTTGACAAGACATACGAACCCCTTTATGACGGCTCCAAGACAAATATTCTCTCTGCTATATTGTTGGTAATGAACTTGAAGGTTATGAATGGTCTTTCAAACATATCAGTCACACGGATGTTAAGGTATGTAATATATTCCATCACATATATATGATTGCGCTAAAGGT
TATCACTGTTCGTCTAATAATTTTATTGTTAATTGATAAGTAAAATTAATACGGATGAAATGTGTTTCATTAATATTATTTCTATATTATATTAACTAGATTTTTATTTTAATTTGTTGTAGCATGATAGGTGAATATTTGTTACCACCTTCAAATATTTTACCTCGCACATATCGAGATTTATTTGCCATCATGAAATA
AATTGGAATGCAGTATGAAGCAATTCATGCATGCCCCAATGATCATGTTCTTTATTACAACCAGCATGAATTTGCAACAGAATGTCCTGAATGTCATATCAGTAGATATCGCACAGATCAAGTAACTAAAAAGGTGCCTCGCAAGGTTCTACGTTATATTCCCATTATTCCCCGTTTGCAACGACTGTTCAGGTGCAAAA
ACATAGCGCAGTTTATGGATTACCATGCACGGAACAGAATTCAAGACGACATTATTCGGATTCCTGCAGATGGGTCTGCATTTAGAGATATGGAGGAAAAATGGCTTCACTTTAAAGACGAACCTCGTAATCTTAGGATTTCTTTGGCAGCAGATGGTGTCAATCATTTTGCAGAGATGAGATCTGTTTACTCAGTGTGG
CCTATTTTTTTTATCAACAACAACATTCCTCCATGTTTGACTATAAAGAGGGAGCACATAATGTTGTCGATGATTATTCCAGgtacgaacactgcagtttttttttattgtagtggtatattctcatttgttgttttttgtctcataatgttatatgtatatttaaagtttttctattgtaaaatatggtttatatatct
aaatggtacgtctcataatcagaatatttattttatatgttcaaatcaatcagGTAAGTACCAAGTCAAAGATATGAATGTATATATCGAACCTCTTATTGACGAGCTACTGAAGTTATGGAATGGCATCACTATGTATGACTTATATAGACCAATACGACAAAGGCAATTCCAATTCCATGCAATGCTTGTATGGACAA
TACATGATGCCCCAGGGTTAACCCATTTCTGTGGTCTTCAGACAAAGGAAAAATTTGCATGTCCAGTTTGTGGTCCTAAGATCAAATCTCGTCGTTCAAAAAGCTTAGGAAAGGAGGTGTTTGATGAGTATAGGCACTTCTTGTCCAAGAATCACAGGTATCGAACTATCGAAAAACATCTTTTCAATGGCAAGCAAGAG
ACTGCATTAAAACCAAAGAGAATGACACCTCAGCTATGGAAGTTGCAATATAATAGAAATCGTCAAGGCATTAATGGGCTTCCACGAGGAATGAAAAGTTATCCTAGACAATTTAGTAGGTTGCCCTATTATGAGCACCTACAAATTGCTCATCTATTTGATACAATGCATATCGGAAAGAATGTGACTACAACATTATG
GCGAATATTGGATGGAAGGAGTGACACAGAAAAAATTGTCAAAATTTGCAAAGACATTCAAGATAACAACCATGCAATGAAAGACGTCATTCAATTTCATAGCAACGGAGAGCAAATTAATATAAACTCACTTCCATGGATGTTAACGGACCAGCAAAGTAATGTTGTAAAAGAAGTCATTCGAAAAATTAAATTTTCCA
CCGGATTTTGTGTGAACATGAAGAATATCATAACAAAGAAAGGTGATTTCGCGGGGGTGAAAACGCACGATTGGCATGTCTTCATGAAGGTAATAATTAATATGGTATGCATTTAATAAGTATTTTTTTTCTTTTTCTAGTACTCTTTTTCAATATACTGAAACTATTTGGATATTATTGTTACAGTATGTTCTACCT