NA ----> NA
Intron 1 GTAATGAGTC ... TCACATGAAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 48.57 | 9 | 8 | 9 |
| A2 | 53.49 | 10 | 14 | 9 |
| A3 | 33.33 | 5 | 4 | 1 |
| A4 | 62.96 | 5 | 8 | 9 |
| A5 | 83.33 | 1 | 8 | 2 |
| A6 | 41.67 | 7 | 3 | 7 |
| A7 | 41.94 | 18 | 10 | 16 |
| A8 | 46.84 | 21 | 16 | 21 |
| A9 | 34.88 | 14 | 4 | 11 |
| A10 | 44.19 | 12 | 11 | 8 |
>TRINITY_DN43914_c0_g1_i2 from sample A10 / Example spliced isoformAATGGGTTCAGTATTTAAGAAGCATTAAAGAGCTTCCTTTGATTATTAGTCGGAATATATGGTTGCTCAAGAATCTTGTCTTATTTGAGAATCATCAAGCCGATGTCGTTAAAGTTGTGTAAAAAGCATTGCAGCCTTTAGAGAACTTTATGAAGAATATGCGGGGCGAGGAAAGGTGTGGGGGAGGAAAGGAAGTTTAA
TTAGTCTCCCAGCTTTAAAATAAGTAATACCTGTGGGTAAGGTAAATGCAGGCTTTCAATTCAAATGTCGGATGGTTTGTGGTAAAGGATCCAATACCAGGCCAGAGCTTTTGGGCCTGTGGATTATTTTTCTTTGCTCTTTTAGAAAGGTTTGAATTCATTTCAAGTGATAGGAGGCTCAAAGATAATCATTGGATGGG
CAGATAAAAAATCAGGGCTACAGGTGAATATGTCAGCCATTGGAATCAAGGATATGACATCTTCAATTTCAGTTTCAGTCATTCAACTATCATCAATTCTATGGGGAGCTAAATGTAGGAGCTGGATCCTCTTTAAAAAAATCTCTCGCTTCCAGGTGGTTTTGGAAGCAAAGGATACTACATCTTCAAGCTCAGTTCCA
GGCAATCAACTATCATCATATCTATAGGGAGTTAAATGGTGGAGTTGATTCCCTTTCAAAAAAAGCTCTCGGTTCCAGGGAATGAGTCCTATTATTAGGAATACAGCTACAATTTATTGAGAAATGCTGTTTCTTCGTAGTTATTTTAGATATTAGTCTGTAGGTCCATTGCTTAGATATTTCTGGGTTTGTATATGTAA
GGTCTCAGATAAGTTTGAAACCATTTATAGCTGAGATGTCTGTAGAAAACTGTTTTTGTATGGAAATGTAGAGAAAGAGATTAGACTGTCTTCTATGGAAAACCTTGTGAAATATGTATATCCAGTGAAGGATAGAAAACCAGGATGGGTGTGTTAGTCCTATACATGATTTTGTAAAATCTTTTAGTATGCTTTGATTC
AACTTATCGGAATACCTAGTATACAGATTTTTTCCAGTTAAAGAAAAAATAATCATGTTGAGGATACAAGCTTGCCC
>TRINITY_DN43914_c0_g1_i1 from sample A10 / Example unspliced isoform:AATGGGTTCAGTATTTAAGAAGCATTAAAGAGCTTCCTTTGATTATTAGTCGGAATATATGGTTGCTCAAGAATCTTGTCTTATTTGAGAATCATCAAGCCGATGTCGTTAAAGTTGTGTAAAAAGCATTGCAGCCTTTAGAGAACTTTATGAAGAATATGCGGGGCGAGGAAAGGTGTGGGGGAGGAAAGGAAGTTTAA
TTAGTCTCCCAGCTTTAAAATAAGTAATACCTGTGGGTAAGGTAAATGCAGGCTTTCAATTCAAATGTCGGATGGTTTGTGGTAAAGGATCCAATACCAGGCCAGAGCTTTTGGGCCTGTGGATTATTTTTCTTTGCTCTTTTAGAAAGGTTTGAATTCATTTCAAGTGATAGGAGGCTCAAAGATAATCATTGGATGGG
CAGATAAAAAATCAGGGCTACAGGTGAATATGTCAGCCATTGGAATCAAGGATATGACATCTTCAATTTCAGTTTCAGTCATTCAACTATCATCAATTCTATGGGGAGCTAAATGTAGGAGCTGGATCCTCTTTAAAAAAATCTCTCGCTTCCAGgtaatgagtcctatgatgaggaatgtagatacattttattgagaa
atgctggttcattgcatttattttagatattactctgtgaatccatggcttagatatttttgggtttgattatgaggaatgtagatacattttattgagaatgctggttctttgcagttattttagatattagtctgtggatccatgtcttagatattttttgggtttgtatatgtaagctaggttttagattagttttg
gaactatttatagctgagatgtttgcagaaaactgttgggaaatttccagtcttgttttttatcaatgaaatatagagaaagcagggattagatggtcttctatagaaagtacgaaggatgttagtcctgtaaatgtttttataaaatcttttagtatgctttgatgtggatgtggtagtcctctgctttgattcaactt
ctgtgcataccaagtagacagtgtttttccaggtgaaaaaaagaatcatgtgatgaggatacatgctttctaattgtagcagactgttaataaattttcactgaatatgtgaatatagattcttaatcaaagatcctgcttagagtgtccatttattagttcgttattcccacgttagaactttatagttttataatgat
atgtaacaatgcccaagaaccttgaaatatgattcgtggtttgagaaaaaagggaagcaattgcatttattagtgttttgtctaataaaattcagcgtaaatcataaagtgcttacatatggtctctttgctcacatgaagGTGGTTTTGGAAGCAAAGGATACTACATCTTCAAGCTCAGTTCCAGGCAATCAACTATC
ATCATATCTATAGGGAGTTAAATGGTGGAGTTGATTCCCTTTCAAAAAAAGCTCTCGGTTCCAGGGAATGAGTCCTATTATTAGGAATACAGCTACAATTTATTGAGAAATGCTGTTTCTTCGTAGTTATTTTAGATATTAGTCTGTAGGTCCATTGCTTAGATATTTCTGGGTTTGTATATGTAAGGTCTCAGATAAGT
TTGAAACCATTTATAGCTGAGATGTCTGTAGAAAACTGTTTTTGTATGGAAATGTAGAGAAAGAGATTAGACTGTCTTCTATGGAAAACCTTGTGAAATATGTATATCCAGTGAAGGATAGAAAACCAGGATGGGTGTGTTAGTCCTATACATGATTTTGTAAAATCTTTTAGTATGCTTTGATTCAACTTATCGGAATA
CCTAGTATACAGATTTTTTCCAGTTAAAGAAAAAATAATCATGTTGAGGATACAAGCTTGCCC