sp|Q9FK63|CARLK_ARATH ----> Calmodulin-binding receptor kinase CaMRLK

Intron 1 GTCCGTGCAC ... GTCGTTACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	80.59	1.7	3	10
A2	86.67	0.3	1.7	1
A3	100	0	7	5
A4	100	0	5	7
A5	50	2	2	2
A6	80.49	4.3	15.7	20
A7	57.96	5.3	7.7	7
A8	68.37	5.3	9	14
A9	80.95	2	7	10
A10	93.94	0.3	0.7	8

>TRINITY_DN37845_c0_g1_i1 from sample A6 / Example spliced isoform

GATCTTGCTGCAACCTTGGAAAGTGCAGAGGTTTTAGAGTGAAGCTCAGTTTTGCACGGAAGGTGGGAAAGTGATGACTACAAAGCTGTGAAGGTTGGTGTATTGAATGATAACTGAGAGATTACATCATTGCTTTGAGTCCCCCTACTGTTATTCCAGTAGCAGAAATGTTCACCACGGGGGGTACCTAAGGTTTTCTT
TTAAGTTTTTCAATATACAATTCAAATAATGTCAGTATGGTATCCTATGCGAATAATGATTGTATTGCTTTTTTTTTCTTTTCGGGTGGACCTCGGTTTTTATCTAATGTAGTCAGCCATTGGAATTAGCATTGTAGGTTATCTTCATATTTCAAACATTGCTTAAAATGTTTGGGTATCAATGCCATCAGCTTTTGTCA
TCGGGTGGCATTGTAAGGCAGCTTCATATTCCAAGCATTGCTTGTTAAAATGTTTGGGTATCAATACCATCAGCTTTTGTCTCCGTGTGGGCGCTGCTTTATTAAGTGTAATTTTTTCTTCTAATTCTCTTTTAATTATTATAGGTTTATTTTTTTCTTCTTTTTCACTTTTATTTATTAGAGTTACCAGATGTAACTTA
AGTAATAAATGTTGTATGGATGGAGATATACATTTTTAGATTTAAAGATGTATATCTTAGTATATAGAATATCTATTAATTTCTTG

>TRINITY_DN37845_c0_g1_i2 from sample A6 / Example unspliced isoform:

GGAATGGGTTCCACTAACAGGGGAGTTCCCAAAGTGGTCTCAGGTAGGCGTTATTATATGAAACTATAAATGATTATATTCATTAAACTTTGATTATATTCATTAAACTTTGGAGTTCTTTCTCATTTCATAAATTGCATATAAGGCACTGTTCCCACTTTGAAGGATCGTTAGGATGTCCATTTGAAAAAACACTTTCT
AAATTCAAAGTGCAGAGGTTTTAGAGTGAAGCTCAGTTTTGCACGGAAGGTGGGAAAGTGATGACTACAAAGCTGTGAAGGTTGGTGTATTGAATGATAACTGAGAGgtccgtgcactaaacttgcaattcagacttttttttcttgaattcgtataaagttagtgctttcatggatggttaccgttctcacatttctgc
agctttttctaatgatatatgatggcgtatacgtgtcgttacagATTACATCATTGCTTTGAGTCCCCCTACTGTTATTCCAGTAGCAGAAATGTTCACCACGGGGGGTACCTAAGGTTTTCTTTTAAGTTTTTCAATATACAATTCAAATAATGTCAGTATGGTATCCTATGCGAATAATGATTGTATTGCTTTTTTTT
TCTTTTCGGGTGGACCTCGGTTTTTATCTAATGTAGTCAGCCATTGGAATTAGCATTGTAGGTTATCTTCATATTTCAAACATTGCTTAAAATGTTTGGGTATCAATGCCATCAGCTTTTGTCATCGGGTGGCATTGTAAGGCAGCTTCATATTCCAAGCATTGCTTGTTAAAATGTTTGGGTATCAATACCATCAGCTT
TTGTCTCCGTGTGGGCGCTGCTTTATTAAGTGTAATTTTTTCTTCTAATTCTCTTTTAATTATTATAGGTTTATTTTTTTCTTCTTTTTCACTTTTATTTATTAGAGTTACCAGATGTAACTTAAGTAATAAATGTTGTATGGATGGAGATATACATTTTTAGATTTAAAGATGTATATCTTAGTATATAGAATATCTAT
TAATTTCTTG