SEARCH OPTIONS

lncRNA id
CNCI status
Max. peptide length
Is conserved?
Organ-specific expression:
Max. expression
No. of exons
Order results by

Current search details:

Found 6583 records

CNCI status:   #
Max. peptide length:   #
Is conserved:   #
Organ specific:   #
Max. expression:   #
No. of exons:   #
Order by:   lncRNA ID


Record details CANTATAdb ID Species Location CNCI status (score) Swiss-Prot best hit Max. peptide length Max. expression No. of exons Notes
CNT30518519 Juglans regia 15:1537184-1548045 (-) coding (0.03)- 74 0.22 3
CNT30518518 Juglans regia 15:3198687-3200272 (-) noncoding (-0.0106496)5e-70 (sp|Q9SW11|PUB35_ARATH) 40 51.85 2
CNT30518517 Juglans regia 15:7635817-7637115 (-) noncoding (-0.004096)- 57 88.16 2
CNT30518515 Juglans regia 15:5715423-5733591 (+) noncoding (-0.036864)- 36 9.87 3
CNT30518514 Juglans regia 15:19044537-19045375 (-) noncoding (-0.032768)1e-72 (sp|Q93ZT6|IF4G1_ARATH) 60 12.22 2
CNT30518513 Juglans regia 15:4259493-4313276 (-) noncoding (-0.0303104)8e-74 (sp|P17801|KPRO_MAIZE) 88 9.68 3
CNT30518512 Juglans regia 15:7810821-7811536 (-) noncoding (-0.008192)- 81 89.53 2
CNT30518511 Juglans regia 15:4439091-4440766 (+) noncoding (-0.1490944)- 50 13.04 4
CNT30518510 Juglans regia 15:18867982-18871149 (-) noncoding (-0.1286144)- 90 5.9 3
CNT30518509 Juglans regia 15:14864574-14865499 (-) noncoding (-0.034816)- 38 3.23 1
CNT30518508 Juglans regia 15:1058976-1061705 (-) noncoding (-0.036864)- 56 27.16 2
CNT30518507 Juglans regia 15:5535564-5556360 (-) noncoding (-0.0548864)0.00000000000003 (sp|Q9FYK2|CML25_ARATH) 78 220.74 3
CNT30518506 Juglans regia 15:4439072-4441322 (+) coding (0.297)- 67 11.44 4
CNT30518505 Juglans regia 15:14266696-14267165 (-) noncoding (-0.077824)- 89 1.51 2
CNT30518504 Juglans regia 15:14871257-14872755 (-) noncoding (-0.0131072)- 59 2.78 2
CNT30518503 Juglans regia 15:10215711-10217721 (-) noncoding (-0.016384)- 43 4.07 4
CNT30518502 Juglans regia 15:18273205-18274743 (-) noncoding (-0.0192512)6e-58 (sp|Q1KXQ8|NU1C_HELAN) 33 98.35 2Conserved counterparts:
CNT30518501 Juglans regia 15:19208839-19211641 (-) noncoding (-0.098304)- 76 6.34 2
CNT30518500 Juglans regia 15:6469196-6470004 (-) noncoding (-0.04096)- 63 29.69 1
CNT30518498 Juglans regia 15:19487403-19488474 (-) noncoding (-0.0462848)4e-68 (sp|O65554|CIPK6_ARATH) 83 1.17 2Conserved counterparts:
CNT30518496 Juglans regia 15:258225-258816 (-) noncoding (-0.04096)- 77 0.3 2Conserved counterparts:
CNT30518495 Juglans regia 15:42606-44273 (+) noncoding (-0.049152)7e-31 (sp|Q42806|KPYC_SOYBN) 88 7.23 2
CNT30518494 Juglans regia 15:5828937-5829949 (+) noncoding (-0.0454656)- 63 2.08 1
CNT30518493 Juglans regia 15:16534580-16536378 (+) noncoding (-0.0004096)- 35 2.19 2
CNT30518492 Juglans regia 15:7242264-7253160 (-) noncoding (-0.057344)- 98 8.29 4
CNT30518491 Juglans regia 15:4838018-4839295 (+) noncoding (-0.0004096)- 71 10.3 2
CNT30518490 Juglans regia 15:537324-538422 (-) noncoding (-0.049152)- 61 19.81 1
CNT30518489 Juglans regia 15:19606273-19606993 (-) noncoding (-0.004096)- 89 19.67 2
CNT30518486 Juglans regia 15:7316514-7324841 (+) noncoding (-0.0004096)- 58 0 2
CNT30518485 Juglans regia 15:6842048-6845596 (-) noncoding (-0.0077824)3e-24 (sp|Q9FIM6|SBT48_ARATH) 54 3.16 3
CNT30518483 Juglans regia 15:3198694-3200272 (-) noncoding (-0.043008)2e-68 (sp|Q9SW11|PUB35_ARATH) 41 42.37 2
CNT30518482 Juglans regia 15:5818876-5826482 (-) noncoding (-0.053248)- - 51.25 2
CNT30518481 Juglans regia 15:14502384-14504349 (-) noncoding (-0.0524288)- 87 2.94 2Conserved counterparts:
CNT30518480 Juglans regia 15:17518331-17519835 (+) noncoding (-0.0585728)- 77 2.86 1
CNT30518479 Juglans regia 15:3824346-3830156 (+) noncoding (-0.024576)1e-41 (sp|P92523|M860_ARATH) 80 75.97 1
CNT30518478 Juglans regia 15:123092-125626 (+) noncoding (-0.045056)- 80 18.5 2
CNT30518476 Juglans regia 15:5715423-5733487 (+) noncoding (-0.036864)- 36 16.16 3
CNT30518475 Juglans regia 15:16750943-16754367 (+) noncoding (-0.0004096)- 81 7.49 3
CNT30518474 Juglans regia 15:17938992-17941778 (+) noncoding (-0.090112)- 87 3.57 3
CNT30518473 Juglans regia 15:4838015-4841990 (-) noncoding (-0.0004096)- 78 1.7 3
CNT30518472 Juglans regia 15:10212669-10215444 (+) noncoding (-0.06144)- 81 3.03 2
CNT30518471 Juglans regia 15:4257918-4263037 (-) coding (0.076)2e-43 (sp|P17801|KPRO_MAIZE) 47 2.01 2
CNT30518470 Juglans regia 15:2357667-2357986 (+) noncoding (-0.0004096)- - 40.68 1
CNT30518469 Juglans regia 15:11498781-11499694 (-) noncoding (-0.0004096)- 31 11.49 2
CNT30518468 Juglans regia 15:19747389-19770698 (-) noncoding (-0.0241664)0.0000000000003 (sp|Q9LW83|CE101_ARATH) - 7.03 2
CNT30518467 Juglans regia 15:20200343-20202120 (+) noncoding (-0.0466944)- 78 5.35 1
CNT30518466 Juglans regia 15:14640828-14643999 (-) coding (0.081)2e-29 (sp|Q94HW2|POLR1_ARATH) 84 2.34 1
CNT30518465 Juglans regia 15:2889960-2891237 (-) noncoding (-0.22528)- 38 8.01 2
CNT30518464 Juglans regia 15:15428104-15428399 (+) noncoding (-0.0004096)- 53 0.27 2
CNT30518463 Juglans regia 15:16483684-16565935 (-) noncoding (-0.0004096)- 62 9.32 2